More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12160 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_21570  glycerol kinase  61.34 
 
 
503 aa  642    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12160  glycerol kinase  100 
 
 
515 aa  1049    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0041  glycerol kinase  55.49 
 
 
499 aa  553  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.684813  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  53.66 
 
 
493 aa  552  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  53.86 
 
 
494 aa  548  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  54.47 
 
 
502 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  54.47 
 
 
502 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  54.55 
 
 
502 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  54.47 
 
 
502 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  54.47 
 
 
502 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  54.47 
 
 
502 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  54.47 
 
 
502 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  54.65 
 
 
505 aa  548  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  54.37 
 
 
502 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  54.37 
 
 
502 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  54.37 
 
 
502 aa  547  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  53.75 
 
 
494 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  53.56 
 
 
494 aa  545  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  53.94 
 
 
520 aa  545  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  54.37 
 
 
502 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  54.35 
 
 
503 aa  547  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  53.95 
 
 
503 aa  548  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  54.37 
 
 
502 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  53.75 
 
 
494 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  54.15 
 
 
497 aa  546  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  54.37 
 
 
502 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  54.06 
 
 
507 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  54.67 
 
 
498 aa  547  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  54.37 
 
 
502 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  54.06 
 
 
507 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  53.75 
 
 
494 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  54.06 
 
 
507 aa  547  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  54.37 
 
 
502 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  53.16 
 
 
507 aa  545  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  53.75 
 
 
494 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  54.37 
 
 
502 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  53.56 
 
 
494 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  53.75 
 
 
494 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  53.95 
 
 
494 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  53.75 
 
 
494 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  53.36 
 
 
503 aa  542  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  52.77 
 
 
503 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  53.28 
 
 
494 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  53.66 
 
 
505 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  53.66 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  54.03 
 
 
495 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  49.8 
 
 
499 aa  537  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  51.58 
 
 
501 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  52.36 
 
 
501 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  51.38 
 
 
501 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  53.07 
 
 
505 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  52.86 
 
 
496 aa  536  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  50.98 
 
 
500 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  52.75 
 
 
496 aa  536  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  54.51 
 
 
507 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  50.98 
 
 
499 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  53.92 
 
 
498 aa  534  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  52.86 
 
 
513 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  51.49 
 
 
500 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  51.18 
 
 
501 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  52.87 
 
 
505 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  50.79 
 
 
499 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  51.28 
 
 
507 aa  533  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  52.18 
 
 
495 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  51.47 
 
 
500 aa  535  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  53.36 
 
 
504 aa  531  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  50.39 
 
 
499 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  52.77 
 
 
505 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  54.15 
 
 
505 aa  528  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  51.49 
 
 
497 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  50.89 
 
 
501 aa  528  1e-148  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  51.2 
 
 
500 aa  526  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  50.1 
 
 
494 aa  525  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  52.17 
 
 
500 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  50.89 
 
 
498 aa  527  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  52.17 
 
 
500 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  52.08 
 
 
505 aa  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  52.85 
 
 
499 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  49.12 
 
 
496 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  52.96 
 
 
503 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  52.98 
 
 
502 aa  522  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  49.21 
 
 
498 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  52.96 
 
 
503 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  49.12 
 
 
496 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  49.21 
 
 
498 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  52.18 
 
 
495 aa  525  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  51.98 
 
 
500 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  51.98 
 
 
500 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  53.37 
 
 
505 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  51.98 
 
 
500 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  52.96 
 
 
518 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  51.98 
 
 
497 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  49.51 
 
 
496 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  52.96 
 
 
518 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  52.96 
 
 
518 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  52.96 
 
 
518 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  52.96 
 
 
518 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  49.12 
 
 
496 aa  521  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  52.37 
 
 
489 aa  519  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  52.84 
 
 
496 aa  520  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>