28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2510 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2510  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 450 aa  915    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0485  hypothetical protein  27.29 
 
 		 453 aa  204  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445268  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3257  hypothetical protein  32.65 
 
 		 437 aa  189  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4535  hypothetical protein  22.33 
 
 		 419 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0784  hypothetical protein  25.61 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3463  protein of unknown function DUF201  25.84 
 
 		 536 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2640  hypothetical protein  25.84 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3622  hypothetical protein  23.06 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0193  hypothetical protein  25 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0036  protein of unknown function DUF201  21.58 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1267  protein of unknown function DUF201  24.54 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2066  hypothetical protein  23.73 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1432  hypothetical protein  23.61 
 
 		 535 aa  53.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.75335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0420  hypothetical protein  23.55 
 
 		 521 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.72593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0168  hypothetical protein  23.91 
 
 		 538 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0755922  normal  0.554039 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05670  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  25.09 
 
 		 618 aa  50.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.512556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1717  hypothetical protein  21.91 
 
 		 444 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4447  protein of unknown function DUF201  24.43 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0698  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  22.98 
 
 		 585 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0809  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  23.44 
 
 		 587 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3114  pyruvate carboxylase  27.96 
 
 		 1148 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3215  pyruvate carboxylase  23.7 
 
 		 1148 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5043  hypothetical protein  22.57 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3015  pyruvate carboxylase  26.88 
 
 		 1148 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2451  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  26.14 
 
 		 576 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140517  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1271  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  25.35 
 
 		 617 aa  43.9  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5916  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  22.65 
 
 		 587 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4175  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  23.43 
 
 		 584 aa  43.1  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>