11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0485 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0485  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  892    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445268  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2510  protein of unknown function DUF201  27.29 
 
 		 450 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3257  hypothetical protein  20.71 
 
 		 437 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4535  hypothetical protein  30.37 
 
 		 419 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0784  hypothetical protein  27.34 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4447  protein of unknown function DUF201  23.67 
 
 		 427 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2688  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.96 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1717  hypothetical protein  26.37 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1707  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  26.15 
 
 		 399 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0749454  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2314  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.84 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4597  pyruvate carboxylase  25.23 
 
 		 1157 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>