20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1717 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1717  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  891    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2923  hypothetical protein  89.19 
 
 		 444 aa  806    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2066  hypothetical protein  37.35 
 
 		 445 aa  279  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5043  hypothetical protein  29.22 
 
 		 457 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33770  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  25.2 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  26.32 
 
 		 1201 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1267  protein of unknown function DUF201  27.91 
 
 		 471 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4468  hypothetical protein  31.11 
 
 		 153 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  26.79 
 
 		 1200 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  28.97 
 
 		 1204 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0485  hypothetical protein  26.37 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445268  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  26.62 
 
 		 721 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.162597 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  26.53 
 
 		 1241 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1009  pyruvate carboxylase subunit A  27.82 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.716898  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  24.48 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  25.68 
 
 		 1179 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  28.14 
 
 		 1238 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  26.09 
 
 		 665 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5381  biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  25 
 
 		 579 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6396  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  26.72 
 
 		 588 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>