15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1267 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1267  protein of unknown function DUF201  100 
 
 
471 aa  953    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1432  hypothetical protein  37.89 
 
 
535 aa  320  3.9999999999999996e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.75335  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3463  protein of unknown function DUF201  37.42 
 
 
536 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199993  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2640  hypothetical protein  37.42 
 
 
534 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0168  hypothetical protein  36.89 
 
 
538 aa  312  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0755922  normal  0.554039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0193  hypothetical protein  37.03 
 
 
529 aa  308  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0420  hypothetical protein  39.28 
 
 
521 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.72593  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3622  hypothetical protein  35.86 
 
 
530 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0457  hypothetical protein  37.21 
 
 
520 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3257  hypothetical protein  22.57 
 
 
437 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2510  protein of unknown function DUF201  24.54 
 
 
450 aa  56.6  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1717  hypothetical protein  27.91 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2066  hypothetical protein  23.51 
 
 
445 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2923  hypothetical protein  26.11 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4956  biotin carboxylase-like protein  27.59 
 
 
541 aa  43.5  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>