17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3257 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3257  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  880    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2510  protein of unknown function DUF201  32.65 
 
 		 450 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0485  hypothetical protein  20.71 
 
 		 453 aa  136  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445268  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0784  hypothetical protein  23.4 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4535  hypothetical protein  23.79 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1267  protein of unknown function DUF201  23.08 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.97 
 
 		 1040 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4447  protein of unknown function DUF201  24.32 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2923  hypothetical protein  21.15 
 
 		 444 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2205  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  22.97 
 
 		 658 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738027  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3259  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  22.82 
 
 		 659 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2066  hypothetical protein  19.43 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1043  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  26.03 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1717  hypothetical protein  20.07 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0521  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  24.81 
 
 		 448 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0922671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4956  biotin carboxylase-like protein  21.78 
 
 		 541 aa  43.5  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.12 
 
 		 1042 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>