10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2066 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2066  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  901    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1717  hypothetical protein  37.35 
 
 		 444 aa  279  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2923  hypothetical protein  36.3 
 
 		 444 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5043  hypothetical protein  31.64 
 
 		 457 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2510  protein of unknown function DUF201  23.73 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4468  hypothetical protein  34.38 
 
 		 153 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.76 
 
 		 1074 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1116  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  26.84 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1267  protein of unknown function DUF201  23.51 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03803  biotin carboxylase  31.19 
 
 		 675 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>