66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4481 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4481  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  100 
 
 		 342 aa  656    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7350  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  41.49 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5824  hypothetical protein  42.69 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1676  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.92 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2130  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.63 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.8 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3942  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.77 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.81 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0831  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.12 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05070  predicted N-acetylglucosamine kinase  37.36 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.629405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3614  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.33 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3036  hypothetical protein  27.05 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.364678  hitchhiker  0.000035288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2852  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.48 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2007  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.38 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0254624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1390  hexokinase  24.13 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.637507  unclonable  0.000000391885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2621  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.75 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.248705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1126  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  21.19 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414908  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1511  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.91 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1026  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  23.62 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24411  N-acetylglucosamine kinase  25.35 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1491  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.04 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2501  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.21 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1539  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.04 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0974  hypothetical protein  24.48 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.131863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5375  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.2 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.314499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4217  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0191296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3114  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.18 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2935  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.18 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000122964  normal  0.641945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2845  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.37 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1116  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.94 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0080309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3017  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.82 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00939797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1653  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.1 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0892044  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2794  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.18 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0839  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.32 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1667  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.31 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3507  hypothetical protein  25.28 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0124  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.05 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6680  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.62 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1942  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.26 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0292  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.5 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.353366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2559  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.3 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000106379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1312  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.66 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000103615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4757  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.17 
 
 		 316 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2706  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.59 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00102346  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2907  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.65 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.610469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2149  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  29.06 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1084  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.74 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2582  glucosamine kinase  25 
 
 		 291 aa  46.6  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1861  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  28.18 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0296781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0143  hypothetical protein  25.25 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1178  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.74 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000024561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2047  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.04 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3211  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.74 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2647  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.17 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1023  hypothetical protein  26.91 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2752  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.96 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1118  hypothetical protein  26.91 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1144  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.74 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000862311  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0371  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.31 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  31.58 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.93 
 
 		 659 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0197966  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1854  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.48 
 
 		 289 aa  43.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.808281 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0944  hypothetical protein  27.62 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0087  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  33.06 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992685  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2870  hypothetical protein  33.06 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3136  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.39 
 
 		 308 aa  42.7  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235099  normal  0.216629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>