56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5824 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5824  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  617  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891222  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7350  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  53.77 
 
 
313 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4481  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  42.39 
 
 
342 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1676  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.49 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3614  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.07 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480053  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2130  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.42 
 
 
328 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3942  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.81 
 
 
336 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2007  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.24 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0254624  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.85 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2501  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.02 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0831  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.27 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1126  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.72 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0292  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.35 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.353366  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1667  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.84 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1539  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.19 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1491  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.19 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2852  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.34 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5375  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.07 
 
 
348 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.314499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2149  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  23.7 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1791  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  21.85 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.51133  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6680  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.35 
 
 
377 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1390  hexokinase  22.65 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.637507  unclonable  0.000000391885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05070  predicted N-acetylglucosamine kinase  30.34 
 
 
344 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.629405  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1861  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  23.05 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0296781  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.26 
 
 
298 aa  57  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1854  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  39.58 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.808281 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1511  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.39 
 
 
299 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1116  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.54 
 
 
299 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0080309  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2740  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.81 
 
 
314 aa  53.1  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24411  N-acetylglucosamine kinase  25.74 
 
 
320 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3999  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.41 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3136  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.32 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235099  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2483  hypothetical protein  21.29 
 
 
299 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2466  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.42 
 
 
298 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.796811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2794  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.19 
 
 
314 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2257  ATPase family protein  21.29 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.163668  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2559  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000106379 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2273  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  20.91 
 
 
299 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27571  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0839  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.72 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1942  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.8 
 
 
344 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3114  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.94 
 
 
302 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171707  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1633  N-acetylglucosamine kinase  26.7 
 
 
307 aa  46.6  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.935257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0319  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.61 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414732  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3036  hypothetical protein  26.69 
 
 
303 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.364678  hitchhiker  0.000035288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2935  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.53 
 
 
302 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000122964  normal  0.641945 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2466  hypothetical protein  21.4 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2215  ATPase family protein  22.52 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1625  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  22.74 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.386069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3353  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.91 
 
 
300 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2294  hypothetical protein  21.4 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3017  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.26 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00939797  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1653  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.65 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0892044  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2499  hypothetical protein  22.57 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2845  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.11 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0371  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  22.29 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0974  hypothetical protein  24.51 
 
 
369 aa  43.9  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.131863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>