86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2740 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2740  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  100 
 
 
314 aa  609  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0831  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.24 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0371  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.99 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2007  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.19 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0254624  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2501  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.59 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0319  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.65 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414732  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1861  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  29.05 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0296781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2149  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  29.05 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1667  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.91 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1390  hexokinase  30 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.637507  unclonable  0.000000391885 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1633  N-acetylglucosamine kinase  30.27 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.935257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05070  predicted N-acetylglucosamine kinase  40.88 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.629405  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.97 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2852  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.58 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1126  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.13 
 
 
313 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.11 
 
 
296 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3353  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.22 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2794  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.75 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1511  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  39.17 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2559  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.61 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000106379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6680  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  45.78 
 
 
377 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5375  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.67 
 
 
348 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.314499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2845  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.64 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0292  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.7 
 
 
335 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.353366  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2483  hypothetical protein  26.94 
 
 
299 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3136  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235099  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2257  ATPase family protein  26.94 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.163668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1854  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.55 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.808281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1942  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.03 
 
 
344 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2466  hypothetical protein  26.42 
 
 
303 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2294  hypothetical protein  26.42 
 
 
303 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1625  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.45 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.386069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2562  hypothetical protein  25.26 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.516208  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1358  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.43 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1791  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.31 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.51133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2215  ATPase family protein  30.12 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2705  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.11 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0369  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.78 
 
 
340 aa  52.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2909  hypothetical protein  27.39 
 
 
297 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.464357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  30.95 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  42.67 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.28918  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5824  hypothetical protein  33.81 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891222  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2499  hypothetical protein  29.34 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520559  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2047  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  41.1 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4757  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.14 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25330  predicted N-acetylglucosamine kinase  39 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0261612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2273  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.11 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2421  hypothetical protein  24.52 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2706  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.77 
 
 
299 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00102346  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1855  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.73 
 
 
307 aa  49.3  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.591681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3210  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.99 
 
 
338 aa  49.3  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.817518 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1926  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.14 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4023  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  39.74 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0116071  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5366  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.64 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.374079 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3124  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.17 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.025848  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3151  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.57 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000102812  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3114  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.99 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171707  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1676  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.85 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1101  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.21 
 
 
298 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3036  hypothetical protein  33.1 
 
 
303 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.364678  hitchhiker  0.000035288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1026  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  26.26 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1076  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.54 
 
 
318 aa  46.2  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0944  hypothetical protein  33.1 
 
 
301 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2752  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.81 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1312  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.18 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000103615  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2935  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.28 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000122964  normal  0.641945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3017  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.28 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00939797  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1852  N-acetylglucosamine kinase  24.85 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000190255  hitchhiker  0.000260194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1178  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.99 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000024561  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3211  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.99 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000118856  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0555  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.33 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.910694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3999  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.77 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1084  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.43 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500246  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1144  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.43 
 
 
311 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000862311  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0974  hypothetical protein  35.48 
 
 
369 aa  43.5  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.131863 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2466  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.9 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.796811 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0087  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  32.94 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992685  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2870  hypothetical protein  32.94 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3507  hypothetical protein  30.28 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3192  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  32.94 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1653  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.08 
 
 
293 aa  42.7  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0892044  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3445  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  32.94 
 
 
311 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1674  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  32.94 
 
 
311 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3947  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  32.94 
 
 
311 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3105  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  32.94 
 
 
311 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104317  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0124  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.43 
 
 
289 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>