70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1878 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1878  hypothetical protein  100 
 
 		 43 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1454  cyd operon protein YbgT  67.57 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3116  cyd operon protein YbgT  60.53 
 
 		 38 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.889115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2639  cyd operon protein YbgT  57.89 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000399354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1320  cyd operon protein YbgT  57.89 
 
 		 38 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.691826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2991  cyd operon protein YbgT  57.89 
 
 		 38 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3135  cyd operon protein YbgT  57.89 
 
 		 38 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0262102  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2977  cyd operon protein YbgT  57.89 
 
 		 38 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1276  Cyd operon protein YbgT  55.26 
 
 		 39 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000189769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1386  cyd operon protein YbgT  57.89 
 
 		 38 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.874493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0297  cyd operon protein YbgT  63.16 
 
 		 39 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03802  cyd operon protein YbgTEB3  60.53 
 
 		 37 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1567  cyd operon protein YbgT  55.26 
 
 		 38 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.378676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2347  Cyd operon protein YbgT  56.76 
 
 		 37 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.042231  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1241  cyd operon protein YbgT  52.63 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1312  cyd operon protein YbgT  52.63 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00175577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1243  cyd operon protein YbgT  52.63 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0653715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1304  cyd operon protein YbgT  52.63 
 
 		 38 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0821564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2134  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 53 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0559  cyd operon protein YbgT  61.29 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0543  cyd operon protein YbgT  61.29 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1443  cyd operon protein YbgT  61.29 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0146  cyd operon protein YbgT  61.29 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2870  cyd operon protein YbgT  61.29 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1144  cyd operon protein YbgT  64.52 
 
 		 36 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2267  cyd operon protein YbgT, putative  60 
 
 		 526 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0566  cyd operon protein YbgT  54.05 
 
 		 37 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465095  normal  0.164783 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0727  cyd operon protein YbgT-related protein  61.29 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250447  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0722  cyd operon protein YbgT  53.49 
 
 		 42 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2078  cyd operon protein YbgT, putative  52.78 
 
 		 53 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.710828  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2737  cyd operon protein YbgT  47.5 
 
 		 40 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.701146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2819  cyd operon protein YbgT  47.5 
 
 		 40 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2879  cyd operon protein YbgT  47.5 
 
 		 40 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6149  Cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 38 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2205  Cyd operon protein YbgT  47.5 
 
 		 40 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2830  cyd operon protein YbgT  47.5 
 
 		 40 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6532  cyd operon protein YbgT  40.48 
 
 		 40 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1643  cyd operon protein YbgT  55 
 
 		 48 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.824834 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01604  hypothetical protein  59.38 
 
 		 35 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003919  hypothetical protein  59.38 
 
 		 35 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0112397  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3176  cyd operon protein YbgT  61.29 
 
 		 32 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3543  cyd operon protein YbgT  42.86 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3734  cyd operon protein YbgT  57.14 
 
 		 36 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19870  hypothetical protein  58.06 
 
 		 38 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1994  hypothetical protein  48.72 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4150  hypothetical protein  58.06 
 
 		 38 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6117  cyd operon protein YbgT  41.46 
 
 		 40 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352258  normal  0.337321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0452  cyd operon protein YbgT  58.06 
 
 		 32 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1507  cyd operon protein YbgT  62.07 
 
 		 36 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1892  hypothetical protein  59.38 
 
 		 35 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5014  Cyd operon protein YbgT  66.67 
 
 		 48 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546667  normal  0.0941967 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0972  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 33 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1080  YbgT protein  50 
 
 		 34 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6357  Cyd operon protein YbgT  66.67 
 
 		 48 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1307  cyd operon protein YbgT  41.03 
 
 		 43 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0446  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0512  ybgT protein  42.86 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1362  cyd operon protein YbgT  55.56 
 
 		 43 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0849139  normal  0.184491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1538  cyd operon protein YbgT  62.96 
 
 		 47 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.486131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2266  cyd operon protein YbgT  68 
 
 		 49 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1562  cyd operon protein YbgT  55.56 
 
 		 43 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0263793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3365  cyd operon protein YbgT  57.69 
 
 		 49 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1243  cyd operon protein YbgT  52.63 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0275085  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1107  cyd operon protein YbgT  51.43 
 
 		 40 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.925169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2310  cyd operon protein YbgT, putative  54.84 
 
 		 52 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1273  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 37 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0119549  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3093  cyd operon protein YbgT  51.35 
 
 		 38 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.196013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2399  cyd operon protein YbgT  53.85 
 
 		 41 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2364  Cyd operon protein YbgT  64.29 
 
 		 38 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0329  cyd operon protein YbgT  42.86 
 
 		 51 aa  40.8  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000697505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>