54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1307 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1307  cyd operon protein YbgT  100 
 
 		 43 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1562  cyd operon protein YbgT  97.67 
 
 		 43 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0263793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1362  cyd operon protein YbgT  97.67 
 
 		 43 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0849139  normal  0.184491 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1080  YbgT protein  60.61 
 
 		 34 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0972  cyd operon protein YbgT  60.61 
 
 		 33 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6532  cyd operon protein YbgT  62.5 
 
 		 40 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6117  cyd operon protein YbgT  67.57 
 
 		 40 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352258  normal  0.337321 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0636  cyd operon protein YbgT  55.26 
 
 		 40 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3543  cyd operon protein YbgT  70 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2870  cyd operon protein YbgT  56.25 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2399  cyd operon protein YbgT  63.89 
 
 		 41 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0559  cyd operon protein YbgT  56.25 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0543  cyd operon protein YbgT  56.25 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1443  cyd operon protein YbgT  56.25 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0146  cyd operon protein YbgT  56.25 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2714  cyd operon protein YbgT  54.29 
 
 		 38 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000024907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3365  cyd operon protein YbgT  84.62 
 
 		 49 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0727  cyd operon protein YbgT-related protein  56.25 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1454  cyd operon protein YbgT  45 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3176  cyd operon protein YbgT  56.25 
 
 		 32 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0512  ybgT protein  70 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0446  hypothetical protein  70 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0452  cyd operon protein YbgT  53.12 
 
 		 32 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2830  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 40 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2819  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 40 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2205  Cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 40 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01604  hypothetical protein  54.29 
 
 		 35 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1107  cyd operon protein YbgT  57.58 
 
 		 40 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.925169  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003919  hypothetical protein  54.29 
 
 		 35 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0112397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3734  cyd operon protein YbgT  53.57 
 
 		 36 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1878  hypothetical protein  41.03 
 
 		 43 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2267  cyd operon protein YbgT, putative  60 
 
 		 526 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44157  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5014  Cyd operon protein YbgT  39.53 
 
 		 48 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546667  normal  0.0941967 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2737  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 40 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.701146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2879  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 40 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1304  cyd operon protein YbgT  47.37 
 
 		 38 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0821564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6149  Cyd operon protein YbgT  59.26 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0722  cyd operon protein YbgT  40.48 
 
 		 42 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1538  cyd operon protein YbgT  43.59 
 
 		 47 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.486131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0297  cyd operon protein YbgT  64 
 
 		 39 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0566  cyd operon protein YbgT  59.26 
 
 		 37 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465095  normal  0.164783 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03802  cyd operon protein YbgTEB3  48.57 
 
 		 37 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4150  hypothetical protein  59.26 
 
 		 38 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1320  cyd operon protein YbgT  47.37 
 
 		 38 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.691826  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1567  cyd operon protein YbgT  51.43 
 
 		 38 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.378676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6357  Cyd operon protein YbgT  60 
 
 		 48 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1276  Cyd operon protein YbgT  68 
 
 		 39 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000189769  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1892  hypothetical protein  48.57 
 
 		 35 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3116  cyd operon protein YbgT  68 
 
 		 38 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.889115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1144  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 36 aa  40.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0329  cyd operon protein YbgT  56.67 
 
 		 51 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000697505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19870  hypothetical protein  52.94 
 
 		 38 aa  40  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2134  cyd operon protein YbgT  53.57 
 
 		 53 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2078  cyd operon protein YbgT, putative  53.57 
 
 		 53 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.710828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>