38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0329 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0329  cyd operon protein YbgT  100 
 
 		 51 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000697505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2364  Cyd operon protein YbgT  60.53 
 
 		 38 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1538  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 47 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.486131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1107  cyd operon protein YbgT  48.84 
 
 		 40 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.925169  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2267  cyd operon protein YbgT, putative  47.5 
 
 		 526 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0727  cyd operon protein YbgT-related protein  60 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250447  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2870  cyd operon protein YbgT  60 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0559  cyd operon protein YbgT  60 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0543  cyd operon protein YbgT  60 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1443  cyd operon protein YbgT  60 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0146  cyd operon protein YbgT  60 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2737  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 40 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.701146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2879  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 40 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3176  cyd operon protein YbgT  60 
 
 		 32 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5014  Cyd operon protein YbgT  45.45 
 
 		 48 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546667  normal  0.0941967 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2830  cyd operon protein YbgT  64.29 
 
 		 40 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2819  cyd operon protein YbgT  64.29 
 
 		 40 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2205  Cyd operon protein YbgT  64.29 
 
 		 40 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333265  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6357  Cyd operon protein YbgT  62.96 
 
 		 48 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2078  cyd operon protein YbgT, putative  44.19 
 
 		 53 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.710828  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1892  hypothetical protein  64.29 
 
 		 35 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1080  YbgT protein  55.26 
 
 		 34 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0452  cyd operon protein YbgT  56.67 
 
 		 32 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0972  cyd operon protein YbgT  55.26 
 
 		 33 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6149  Cyd operon protein YbgT  64.29 
 
 		 38 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2134  cyd operon protein YbgT  46.34 
 
 		 53 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4150  hypothetical protein  51.35 
 
 		 38 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2714  cyd operon protein YbgT  57.58 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000024907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003919  hypothetical protein  60.71 
 
 		 35 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0112397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01604  hypothetical protein  60.71 
 
 		 35 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0566  cyd operon protein YbgT  45.95 
 
 		 37 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465095  normal  0.164783 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1643  cyd operon protein YbgT  59.26 
 
 		 48 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.824834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0297  cyd operon protein YbgT  64 
 
 		 39 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1878  hypothetical protein  42.86 
 
 		 43 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1362  cyd operon protein YbgT  56.67 
 
 		 43 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0849139  normal  0.184491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1307  cyd operon protein YbgT  56.67 
 
 		 43 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2310  cyd operon protein YbgT, putative  64 
 
 		 52 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1562  cyd operon protein YbgT  56.67 
 
 		 43 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0263793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>