60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0297 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0297  cyd operon protein YbgT  100 
 
 		 39 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2267  cyd operon protein YbgT, putative  70.27 
 
 		 526 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44157  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2078  cyd operon protein YbgT, putative  70.27 
 
 		 53 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.710828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2134  cyd operon protein YbgT  70.27 
 
 		 53 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1443  cyd operon protein YbgT  78.12 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0146  cyd operon protein YbgT  78.12 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0727  cyd operon protein YbgT-related protein  78.12 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250447  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0543  cyd operon protein YbgT  78.12 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259363  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4150  hypothetical protein  63.16 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2870  cyd operon protein YbgT  78.12 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0559  cyd operon protein YbgT  78.12 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2266  cyd operon protein YbgT  68.42 
 
 		 49 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0566  cyd operon protein YbgT  72.73 
 
 		 37 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465095  normal  0.164783 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2830  cyd operon protein YbgT  58.97 
 
 		 40 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2819  cyd operon protein YbgT  58.97 
 
 		 40 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2205  Cyd operon protein YbgT  58.97 
 
 		 40 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333265  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1994  hypothetical protein  70.27 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2879  cyd operon protein YbgT  58.97 
 
 		 40 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0452  cyd operon protein YbgT  75 
 
 		 32 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3176  cyd operon protein YbgT  78.12 
 
 		 32 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2737  cyd operon protein YbgT  58.97 
 
 		 40 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.701146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6149  Cyd operon protein YbgT  57.89 
 
 		 38 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1643  cyd operon protein YbgT  85.19 
 
 		 48 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.824834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2310  cyd operon protein YbgT, putative  85.19 
 
 		 52 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1878  hypothetical protein  63.16 
 
 		 43 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6357  Cyd operon protein YbgT  81.48 
 
 		 48 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5014  Cyd operon protein YbgT  84.62 
 
 		 48 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546667  normal  0.0941967 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1107  cyd operon protein YbgT  60 
 
 		 40 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.925169  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1538  cyd operon protein YbgT  77.78 
 
 		 47 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.486131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3734  cyd operon protein YbgT  57.14 
 
 		 36 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03802  cyd operon protein YbgTEB3  54.05 
 
 		 37 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1454  cyd operon protein YbgT  56.41 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19870  hypothetical protein  55.26 
 
 		 38 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1320  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 38 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.691826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3116  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 38 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.889115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0636  cyd operon protein YbgT  52.63 
 
 		 40 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003919  hypothetical protein  55.88 
 
 		 35 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0112397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2639  cyd operon protein YbgT  52.63 
 
 		 38 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000399354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01604  hypothetical protein  55.88 
 
 		 35 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1386  cyd operon protein YbgT  52.63 
 
 		 38 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.874493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3135  cyd operon protein YbgT  52.63 
 
 		 38 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0262102  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2991  cyd operon protein YbgT  52.63 
 
 		 38 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2347  Cyd operon protein YbgT  52.94 
 
 		 37 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.042231  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2977  cyd operon protein YbgT  52.63 
 
 		 38 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1304  cyd operon protein YbgT  55.88 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0821564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1276  Cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 39 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000189769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1241  cyd operon protein YbgT  47.37 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1312  cyd operon protein YbgT  47.37 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00175577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1243  cyd operon protein YbgT  47.37 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0653715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1567  cyd operon protein YbgT  47.37 
 
 		 38 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.378676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1362  cyd operon protein YbgT  64 
 
 		 43 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0849139  normal  0.184491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1307  cyd operon protein YbgT  64 
 
 		 43 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1562  cyd operon protein YbgT  64 
 
 		 43 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0263793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1144  cyd operon protein YbgT  58.06 
 
 		 36 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1892  hypothetical protein  50 
 
 		 35 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0972  cyd operon protein YbgT  51.52 
 
 		 33 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0329  cyd operon protein YbgT  64 
 
 		 51 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000697505 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1080  YbgT protein  51.52 
 
 		 34 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3543  cyd operon protein YbgT  60 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194241  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1273  cyd operon protein YbgT  48.72 
 
 		 37 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0119549  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>