86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2977 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2991  cyd operon protein YbgT  100 
 
 
38 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2977  cyd operon protein YbgT  100 
 
 
38 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1386  cyd operon protein YbgT  100 
 
 
38 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.874493  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3135  cyd operon protein YbgT  100 
 
 
38 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0262102  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2639  cyd operon protein YbgT  97.37 
 
 
38 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000399354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1243  cyd operon protein YbgT  94.74 
 
 
38 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0653715  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1312  cyd operon protein YbgT  94.74 
 
 
38 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00175577  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1241  cyd operon protein YbgT  94.74 
 
 
38 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134281  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2347  Cyd operon protein YbgT  94.44 
 
 
37 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.042231  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1276  Cyd operon protein YbgT  86.84 
 
 
39 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000189769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3116  cyd operon protein YbgT  86.84 
 
 
38 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.889115  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1567  cyd operon protein YbgT  81.58 
 
 
38 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.378676  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1304  cyd operon protein YbgT  85.71 
 
 
38 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0821564  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1320  cyd operon protein YbgT  88.57 
 
 
38 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.691826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1144  cyd operon protein YbgT  88.57 
 
 
36 aa  67  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03802  cyd operon protein YbgTEB3  83.33 
 
 
37 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003919  hypothetical protein  74.29 
 
 
35 aa  60.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0112397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01604  hypothetical protein  74.29 
 
 
35 aa  60.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1892  hypothetical protein  74.29 
 
 
35 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19870  hypothetical protein  65.79 
 
 
38 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1454  cyd operon protein YbgT  60.53 
 
 
60 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1273  cyd operon protein YbgT  63.89 
 
 
37 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0119549  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1507  cyd operon protein YbgT  88 
 
 
36 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2267  cyd operon protein YbgT, putative  58.82 
 
 
526 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1878  hypothetical protein  57.89 
 
 
43 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0837  cyd operon protein YbgT  61.11 
 
 
37 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000109942  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00683  hypothetical protein  61.11 
 
 
37 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00241441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0787  cyd operon protein YbgT  61.11 
 
 
37 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015959  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0763  cyd operon protein YbgT  61.11 
 
 
37 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2921  cyd operon protein YbgT  61.11 
 
 
37 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0637275  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0656  cyd operon protein YbgT  61.11 
 
 
37 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000732039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0757  cyd operon protein YbgT  61.11 
 
 
37 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000329064  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2901  cyd operon protein YbgT  61.11 
 
 
37 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000241064  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00694  hypothetical protein  61.11 
 
 
37 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00194731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1107  cyd operon protein YbgT  61.76 
 
 
40 aa  50.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.925169  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1243  cyd operon protein YbgT  57.89 
 
 
38 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0275085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3093  cyd operon protein YbgT  57.89 
 
 
38 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.196013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2908  cyd operon protein YbgT  55.26 
 
 
38 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.371317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2078  cyd operon protein YbgT, putative  55.56 
 
 
53 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.710828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0805  cyd operon protein YbgT  56.76 
 
 
37 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0022391  normal  0.440466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0869  cyd operon protein YbgT  56.76 
 
 
37 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0134616  normal  0.134209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0900  cyd operon protein YbgT  56.76 
 
 
37 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00818808  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0778  cyd operon protein YbgT  56.76 
 
 
37 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0838  cyd operon protein YbgT  56.76 
 
 
37 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0482544  normal  0.631013 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1443  cyd operon protein YbgT  61.29 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2962  cyd operon protein YbgT  78.57 
 
 
44 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1390  cyd operon protein YbgT  78.57 
 
 
44 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616526  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0727  cyd operon protein YbgT-related protein  61.29 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250447  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0722  cyd operon protein YbgT  75 
 
 
42 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0146  cyd operon protein YbgT  61.29 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2874  cyd operon protein YbgT  78.57 
 
 
44 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000186186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0543  cyd operon protein YbgT  61.29 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0559  cyd operon protein YbgT  61.29 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2870  cyd operon protein YbgT  61.29 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2134  cyd operon protein YbgT  57.14 
 
 
53 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2266  cyd operon protein YbgT  52.63 
 
 
49 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1232  cyd operon protein YbgT  55.56 
 
 
37 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.287572  normal  0.120863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2879  cyd operon protein YbgT  50 
 
 
40 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2819  cyd operon protein YbgT  50 
 
 
40 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2205  Cyd operon protein YbgT  50 
 
 
40 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333265  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2737  cyd operon protein YbgT  50 
 
 
40 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.701146  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2830  cyd operon protein YbgT  50 
 
 
40 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1150  cyd operon protein YbgT  71.43 
 
 
38 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3176  cyd operon protein YbgT  61.29 
 
 
32 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1994  hypothetical protein  52.63 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0972  cyd operon protein YbgT  60.61 
 
 
33 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6149  Cyd operon protein YbgT  54.55 
 
 
38 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0452  cyd operon protein YbgT  58.06 
 
 
32 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1080  YbgT protein  60.61 
 
 
34 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0566  cyd operon protein YbgT  57.58 
 
 
37 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465095  normal  0.164783 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6357  Cyd operon protein YbgT  72 
 
 
48 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4150  hypothetical protein  44.74 
 
 
38 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2310  cyd operon protein YbgT, putative  61.29 
 
 
52 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5014  Cyd operon protein YbgT  72 
 
 
48 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546667  normal  0.0941967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1538  cyd operon protein YbgT  72 
 
 
47 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.486131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2740  cyd operon protein YbgT  64.29 
 
 
34 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0297  cyd operon protein YbgT  52.63 
 
 
39 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463265  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1533  cyd operon protein YbgT  64.29 
 
 
33 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105022  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3734  cyd operon protein YbgT  52.94 
 
 
36 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1643  cyd operon protein YbgT  68 
 
 
48 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.824834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3543  cyd operon protein YbgT  45.45 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194241  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6117  cyd operon protein YbgT  48.48 
 
 
40 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352258  normal  0.337321 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6532  cyd operon protein YbgT  48.48 
 
 
40 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0512  ybgT protein  45.45 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0446  hypothetical protein  45.45 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3365  cyd operon protein YbgT  60 
 
 
49 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>