50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0869 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0805  cyd operon protein YbgT  100 
 
 		 37 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0022391  normal  0.440466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0869  cyd operon protein YbgT  100 
 
 		 37 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0134616  normal  0.134209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0900  cyd operon protein YbgT  100 
 
 		 37 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00818808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0778  cyd operon protein YbgT  100 
 
 		 37 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0838  cyd operon protein YbgT  100 
 
 		 37 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0482544  normal  0.631013 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2901  cyd operon protein YbgT  86.11 
 
 		 37 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000241064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2921  cyd operon protein YbgT  86.11 
 
 		 37 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0637275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0787  cyd operon protein YbgT  86.11 
 
 		 37 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0757  cyd operon protein YbgT  86.11 
 
 		 37 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000329064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0656  cyd operon protein YbgT  86.11 
 
 		 37 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000732039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0837  cyd operon protein YbgT  86.11 
 
 		 37 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000109942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00683  hypothetical protein  86.11 
 
 		 37 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00241441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00694  hypothetical protein  86.11 
 
 		 37 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00194731  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0763  cyd operon protein YbgT  83.33 
 
 		 37 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354567  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1232  cyd operon protein YbgT  86.11 
 
 		 37 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.287572  normal  0.120863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1273  cyd operon protein YbgT  78.38 
 
 		 37 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0119549  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2908  cyd operon protein YbgT  72.97 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.371317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1243  cyd operon protein YbgT  72.97 
 
 		 38 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0275085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3093  cyd operon protein YbgT  67.57 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.196013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2740  cyd operon protein YbgT  73.53 
 
 		 34 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1533  cyd operon protein YbgT  80.65 
 
 		 33 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1150  cyd operon protein YbgT  63.89 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2874  cyd operon protein YbgT  89.29 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000186186  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2962  cyd operon protein YbgT  89.29 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1390  cyd operon protein YbgT  89.29 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003919  hypothetical protein  71.43 
 
 		 35 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0112397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01604  hypothetical protein  71.43 
 
 		 35 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1144  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 36 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1567  cyd operon protein YbgT  62.16 
 
 		 38 aa  50.1  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.378676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1276  Cyd operon protein YbgT  62.16 
 
 		 39 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000189769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1304  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 38 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0821564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1892  hypothetical protein  65.71 
 
 		 35 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3116  cyd operon protein YbgT  78.57 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.889115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2639  cyd operon protein YbgT  59.46 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000399354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1243  cyd operon protein YbgT  54.05 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0653715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1386  cyd operon protein YbgT  56.76 
 
 		 38 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.874493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2347  Cyd operon protein YbgT  58.33 
 
 		 37 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.042231  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1312  cyd operon protein YbgT  54.05 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00175577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2977  cyd operon protein YbgT  56.76 
 
 		 38 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1241  cyd operon protein YbgT  54.05 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2991  cyd operon protein YbgT  56.76 
 
 		 38 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3135  cyd operon protein YbgT  56.76 
 
 		 38 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0262102  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1320  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 38 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.691826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03802  cyd operon protein YbgTEB3  58.33 
 
 		 37 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1507  cyd operon protein YbgT  62.16 
 
 		 36 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0722  cyd operon protein YbgT  58.82 
 
 		 42 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19870  hypothetical protein  57.89 
 
 		 38 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1107  cyd operon protein YbgT  70.37 
 
 		 40 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.925169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1454  cyd operon protein YbgT  47.37 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2267  cyd operon protein YbgT, putative  64 
 
 		 526 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>