92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1892 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1892  hypothetical protein  100 
 
 		 35 aa  72.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003919  hypothetical protein  94.29 
 
 		 35 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0112397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01604  hypothetical protein  94.29 
 
 		 35 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1304  cyd operon protein YbgT  82.86 
 
 		 38 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0821564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1567  cyd operon protein YbgT  82.86 
 
 		 38 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.378676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1320  cyd operon protein YbgT  82.86 
 
 		 38 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.691826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1144  cyd operon protein YbgT  80 
 
 		 36 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3116  cyd operon protein YbgT  77.14 
 
 		 38 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.889115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2347  Cyd operon protein YbgT  77.14 
 
 		 37 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.042231  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2639  cyd operon protein YbgT  77.14 
 
 		 38 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000399354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1243  cyd operon protein YbgT  74.29 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0653715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1312  cyd operon protein YbgT  74.29 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00175577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1241  cyd operon protein YbgT  74.29 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2991  cyd operon protein YbgT  74.29 
 
 		 38 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2977  cyd operon protein YbgT  74.29 
 
 		 38 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3135  cyd operon protein YbgT  74.29 
 
 		 38 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0262102  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1386  cyd operon protein YbgT  74.29 
 
 		 38 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.874493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1276  Cyd operon protein YbgT  77.14 
 
 		 39 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000189769  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03802  cyd operon protein YbgTEB3  74.29 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19870  hypothetical protein  64.71 
 
 		 38 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1507  cyd operon protein YbgT  62.86 
 
 		 36 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0763  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 37 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354567  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0805  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 37 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0022391  normal  0.440466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0869  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 37 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0134616  normal  0.134209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0900  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 37 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00818808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0778  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 37 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0838  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 37 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0482544  normal  0.631013 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0787  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 37 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015959  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00683  hypothetical protein  65.71 
 
 		 37 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00241441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00694  hypothetical protein  65.71 
 
 		 37 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00194731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2921  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 37 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0637275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0757  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 37 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000329064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1150  cyd operon protein YbgT  66.67 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0656  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 37 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000732039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0837  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 37 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000109942  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2901  cyd operon protein YbgT  65.71 
 
 		 37 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000241064  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1232  cyd operon protein YbgT  62.86 
 
 		 37 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.287572  normal  0.120863 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1390  cyd operon protein YbgT  82.14 
 
 		 44 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1273  cyd operon protein YbgT  78.57 
 
 		 37 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0119549  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2962  cyd operon protein YbgT  82.14 
 
 		 44 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2874  cyd operon protein YbgT  82.14 
 
 		 44 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000186186  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1080  YbgT protein  66.67 
 
 		 34 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0972  cyd operon protein YbgT  66.67 
 
 		 33 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2908  cyd operon protein YbgT  60 
 
 		 38 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.371317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1243  cyd operon protein YbgT  78.57 
 
 		 38 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0275085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2267  cyd operon protein YbgT, putative  68 
 
 		 526 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1454  cyd operon protein YbgT  61.76 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0722  cyd operon protein YbgT  75 
 
 		 42 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3093  cyd operon protein YbgT  75 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.196013  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1107  cyd operon protein YbgT  58.82 
 
 		 40 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.925169  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1538  cyd operon protein YbgT  57.14 
 
 		 47 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.486131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2266  cyd operon protein YbgT  48.57 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0727  cyd operon protein YbgT-related protein  58.06 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250447  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2870  cyd operon protein YbgT  58.06 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0146  cyd operon protein YbgT  58.06 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1443  cyd operon protein YbgT  58.06 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0559  cyd operon protein YbgT  58.06 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0543  cyd operon protein YbgT  58.06 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259363  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3365  cyd operon protein YbgT  58.82 
 
 		 49 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1533  cyd operon protein YbgT  61.76 
 
 		 33 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2740  cyd operon protein YbgT  60 
 
 		 34 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1878  hypothetical protein  59.38 
 
 		 43 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3176  cyd operon protein YbgT  58.06 
 
 		 32 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2819  cyd operon protein YbgT  60.71 
 
 		 40 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0329  cyd operon protein YbgT  64.29 
 
 		 51 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000697505 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2134  cyd operon protein YbgT  68 
 
 		 53 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2078  cyd operon protein YbgT, putative  48.57 
 
 		 53 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.710828  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6149  Cyd operon protein YbgT  60.71 
 
 		 38 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0452  cyd operon protein YbgT  54.84 
 
 		 32 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1994  hypothetical protein  48.57 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2205  Cyd operon protein YbgT  60.71 
 
 		 40 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333265  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2879  cyd operon protein YbgT  60.71 
 
 		 40 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2737  cyd operon protein YbgT  60.71 
 
 		 40 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.701146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2830  cyd operon protein YbgT  60.71 
 
 		 40 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0566  cyd operon protein YbgT  48.57 
 
 		 37 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465095  normal  0.164783 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5014  Cyd operon protein YbgT  51.43 
 
 		 48 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546667  normal  0.0941967 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6357  Cyd operon protein YbgT  68 
 
 		 48 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2310  cyd operon protein YbgT, putative  68 
 
 		 52 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6532  cyd operon protein YbgT  68 
 
 		 40 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6117  cyd operon protein YbgT  68 
 
 		 40 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352258  normal  0.337321 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3543  cyd operon protein YbgT  60 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0297  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 39 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4150  hypothetical protein  45.71 
 
 		 38 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2714  cyd operon protein YbgT  51.43 
 
 		 38 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000024907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2399  cyd operon protein YbgT  52.94 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1362  cyd operon protein YbgT  48.57 
 
 		 43 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0849139  normal  0.184491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1643  cyd operon protein YbgT  48.57 
 
 		 48 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.824834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1562  cyd operon protein YbgT  48.57 
 
 		 43 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0263793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1307  cyd operon protein YbgT  48.57 
 
 		 43 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3734  cyd operon protein YbgT  50 
 
 		 36 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0446  hypothetical protein  60 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0512  ybgT protein  60 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>