35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2714 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2714  cyd operon protein YbgT  100 
 
 
38 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000024907  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3365  cyd operon protein YbgT  55.56 
 
 
49 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1562  cyd operon protein YbgT  54.29 
 
 
43 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0263793  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1362  cyd operon protein YbgT  54.29 
 
 
43 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0849139  normal  0.184491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1307  cyd operon protein YbgT  54.29 
 
 
43 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2267  cyd operon protein YbgT, putative  61.54 
 
 
526 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44157  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2819  cyd operon protein YbgT  54.84 
 
 
40 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0972  cyd operon protein YbgT  76 
 
 
33 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1080  YbgT protein  76 
 
 
34 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2830  cyd operon protein YbgT  54.84 
 
 
40 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2737  cyd operon protein YbgT  54.84 
 
 
40 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.701146  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2870  cyd operon protein YbgT  56.67 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0559  cyd operon protein YbgT  56.67 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0543  cyd operon protein YbgT  56.67 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1443  cyd operon protein YbgT  56.67 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0146  cyd operon protein YbgT  56.67 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2879  cyd operon protein YbgT  54.84 
 
 
40 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2205  Cyd operon protein YbgT  54.84 
 
 
40 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333265  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6149  Cyd operon protein YbgT  54.84 
 
 
38 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0727  cyd operon protein YbgT-related protein  56.67 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250447  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6117  cyd operon protein YbgT  50 
 
 
40 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352258  normal  0.337321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2399  cyd operon protein YbgT  48.57 
 
 
41 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280485  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0329  cyd operon protein YbgT  57.58 
 
 
51 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000697505 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5014  Cyd operon protein YbgT  52.78 
 
 
48 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546667  normal  0.0941967 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1567  cyd operon protein YbgT  48.65 
 
 
38 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.378676  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03802  cyd operon protein YbgTEB3  55.56 
 
 
37 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6532  cyd operon protein YbgT  50 
 
 
40 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3176  cyd operon protein YbgT  58.62 
 
 
32 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1454  cyd operon protein YbgT  57.14 
 
 
60 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0452  cyd operon protein YbgT  55.17 
 
 
32 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3543  cyd operon protein YbgT  60 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3734  cyd operon protein YbgT  58.62 
 
 
36 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1892  hypothetical protein  51.43 
 
 
35 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0566  cyd operon protein YbgT  45.95 
 
 
37 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465095  normal  0.164783 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6357  Cyd operon protein YbgT  47.62 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>