46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2368 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2070  subtilase family protein  91.78 
 
 
584 aa  1099    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.725606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2368  subtilase family protein  100 
 
 
584 aa  1182    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2888  serine protease A  39.53 
 
 
578 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2886  serine protease C  39.93 
 
 
582 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2369  subtilase family protein  40.81 
 
 
536 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2071  subtilisin like protease  39.76 
 
 
553 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1571  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.92 
 
 
559 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1573  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 
559 aa  279  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1572  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.43 
 
 
559 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3538  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.98 
 
 
571 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1574  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.93 
 
 
560 aa  266  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.266875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1576  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.96 
 
 
559 aa  259  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1575  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.55 
 
 
561 aa  257  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0287322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0532  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.3 
 
 
582 aa  247  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0318765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2567  protease CspB  31.62 
 
 
564 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2817  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.34 
 
 
538 aa  239  9e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2887  protease CspB  31.53 
 
 
565 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1811  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.46 
 
 
618 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5457  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.29 
 
 
715 aa  104  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53699  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.39 
 
 
578 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0383041  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  33.88 
 
 
1406 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  33.06 
 
 
1407 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  33.06 
 
 
1407 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  33.06 
 
 
1407 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.67 
 
 
860 aa  51.2  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4218  hypothetical protein  19.03 
 
 
648 aa  50.4  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0791  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.69 
 
 
835 aa  47.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.3 
 
 
995 aa  47  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.14 
 
 
370 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.54 
 
 
860 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.16 
 
 
883 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0676  proteinase, putative  23.38 
 
 
885 aa  46.2  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.92 
 
 
327 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  25.56 
 
 
1570 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  25.56 
 
 
1570 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8381  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  24.77 
 
 
410 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4652  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.44 
 
 
986 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0586324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.62 
 
 
1876 aa  44.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  33.93 
 
 
917 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.51 
 
 
1054 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  33.98 
 
 
917 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  33.98 
 
 
917 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  33.93 
 
 
917 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.26 
 
 
1052 aa  43.9  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3547  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.09 
 
 
556 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  24.83 
 
 
2042 aa  43.9  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>