34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2886 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2886  serine protease C  100 
 
 
582 aa  1187    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2888  serine protease A  50.77 
 
 
578 aa  611  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2368  subtilase family protein  39.93 
 
 
584 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2070  subtilase family protein  40.07 
 
 
584 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.725606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2369  subtilase family protein  39.22 
 
 
536 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2071  subtilisin like protease  38.51 
 
 
553 aa  353  7e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3538  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.31 
 
 
571 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1571  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.17 
 
 
559 aa  293  6e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1574  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.97 
 
 
560 aa  274  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.266875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1573  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.66 
 
 
559 aa  273  9e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1572  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.21 
 
 
559 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1575  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.16 
 
 
561 aa  260  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0287322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0532  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.21 
 
 
582 aa  256  8e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0318765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1576  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.84 
 
 
559 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2817  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.81 
 
 
538 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2887  protease CspB  32.41 
 
 
565 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2567  protease CspB  32.16 
 
 
564 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1811  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.22 
 
 
618 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.41 
 
 
578 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0383041  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5457  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.32 
 
 
715 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53699  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
891 aa  57.4  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4218  hypothetical protein  21.82 
 
 
648 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30 
 
 
860 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5781  hypothetical protein  25.2 
 
 
748 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112335  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.62 
 
 
860 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.46 
 
 
883 aa  47.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  24.04 
 
 
307 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.7 
 
 
327 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.15 
 
 
509 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  29.37 
 
 
1407 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  29.37 
 
 
1407 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  29.37 
 
 
1406 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  29.37 
 
 
1407 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.42 
 
 
878 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>