15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4218 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4218  hypothetical protein  100 
 
 
648 aa  1315    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5781  hypothetical protein  35.92 
 
 
748 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112335  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1811  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.32 
 
 
618 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1576  hypothetical protein  27.26 
 
 
689 aa  117  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149028  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5457  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.95 
 
 
715 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53699  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3530  hypothetical protein  25.79 
 
 
679 aa  92.8  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0336429 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2817  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.4 
 
 
538 aa  67  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0532  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.25 
 
 
582 aa  61.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0318765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2886  serine protease C  21.82 
 
 
582 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
578 aa  50.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0383041  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2368  subtilase family protein  18.87 
 
 
584 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1572  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  19.85 
 
 
559 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2567  protease CspB  18.18 
 
 
564 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2887  protease CspB  19.64 
 
 
565 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2070  subtilase family protein  17.99 
 
 
584 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.725606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>