34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2369 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2369  subtilase family protein  100 
 
 
536 aa  1088    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2071  subtilisin like protease  92.91 
 
 
553 aa  1026    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2888  serine protease A  42.49 
 
 
578 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2368  subtilase family protein  40.81 
 
 
584 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2070  subtilase family protein  40.61 
 
 
584 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.725606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2886  serine protease C  39.22 
 
 
582 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3538  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.14 
 
 
571 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1573  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.14 
 
 
559 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1571  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.67 
 
 
559 aa  263  6e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1572  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.53 
 
 
559 aa  263  8e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1574  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.95 
 
 
560 aa  260  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.266875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1575  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.15 
 
 
561 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0287322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1576  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.55 
 
 
559 aa  243  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0532  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.12 
 
 
582 aa  238  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0318765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2817  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.86 
 
 
538 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2567  protease CspB  32.7 
 
 
564 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2887  protease CspB  31.65 
 
 
565 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1811  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.34 
 
 
618 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5457  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.5 
 
 
715 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53699  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.49 
 
 
578 aa  81.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0383041  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.88 
 
 
883 aa  60.1  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.9 
 
 
577 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27 
 
 
1029 aa  51.6  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.82 
 
 
327 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.84 
 
 
1797 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.62 
 
 
860 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.8 
 
 
1776 aa  47.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3055  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.59 
 
 
483 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154731  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.49 
 
 
1361 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.67 
 
 
860 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.91 
 
 
891 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  30.89 
 
 
1962 aa  45.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.03 
 
 
479 aa  43.5  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  26.14 
 
 
2042 aa  43.5  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>