282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01170 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE01170  cation-transporting ATPase, putative  100 
 
 
780 aa  1597    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_19857  Heat Shock Protein 90, endoplasmic reticulum  38.71 
 
 
794 aa  484  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.768315  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_55215  heat shock protein Hsp90  37.11 
 
 
780 aa  411  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23829  Heat Shock Protein 90  37.08 
 
 
711 aa  409  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26093  Heat Shock Protein 90, cytosolic  35.41 
 
 
699 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0130023 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01520  chaperone, putative  36.15 
 
 
700 aa  388  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.724497  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08269  heat shock protein 90 (Eurofung)  35.37 
 
 
700 aa  385  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.723731 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16786  predicted protein  33.51 
 
 
716 aa  385  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_55230  predicted protein  35.74 
 
 
709 aa  382  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69965  Heat shock protein 90 homolog  35.28 
 
 
709 aa  358  1.9999999999999998e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0615348  normal  0.460781 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  34.34 
 
 
652 aa  342  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  34.25 
 
 
630 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0551  heat shock protein 90  33.09 
 
 
634 aa  333  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  33.43 
 
 
635 aa  331  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  33.57 
 
 
624 aa  331  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  33.1 
 
 
628 aa  331  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  33.67 
 
 
623 aa  330  5.0000000000000004e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  33.57 
 
 
624 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  33.57 
 
 
624 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  33.57 
 
 
624 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  34.01 
 
 
633 aa  330  7e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  32.8 
 
 
632 aa  330  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  33.57 
 
 
624 aa  330  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  34.15 
 
 
632 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  33.43 
 
 
639 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  33.71 
 
 
624 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  33.71 
 
 
624 aa  328  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  33.71 
 
 
624 aa  328  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  33.91 
 
 
640 aa  328  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  34 
 
 
632 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  34 
 
 
632 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  33.29 
 
 
622 aa  328  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  34 
 
 
632 aa  328  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  33.29 
 
 
624 aa  328  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  33.71 
 
 
624 aa  328  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  33.29 
 
 
624 aa  328  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  34 
 
 
632 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  33.71 
 
 
624 aa  328  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  33.71 
 
 
624 aa  328  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  34 
 
 
632 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  33.71 
 
 
624 aa  328  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  33.71 
 
 
624 aa  328  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  32.23 
 
 
636 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  33 
 
 
624 aa  327  4.0000000000000003e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  32.95 
 
 
626 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  33.71 
 
 
624 aa  327  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  33.86 
 
 
632 aa  327  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  33.24 
 
 
623 aa  327  7e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  32.28 
 
 
628 aa  327  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  32.28 
 
 
628 aa  327  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  33.86 
 
 
632 aa  326  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  33.43 
 
 
637 aa  326  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  33.57 
 
 
630 aa  326  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  33.38 
 
 
647 aa  325  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  33.33 
 
 
629 aa  324  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0956  heat shock protein 90  33.62 
 
 
634 aa  324  4e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.538924  normal  0.713469 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  34.43 
 
 
632 aa  323  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  32.62 
 
 
634 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  32.09 
 
 
640 aa  322  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  33.48 
 
 
643 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  32.09 
 
 
626 aa  321  3e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  32.52 
 
 
638 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3901  heat shock protein 90  31.18 
 
 
653 aa  320  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.795746  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  33.19 
 
 
643 aa  319  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  32.13 
 
 
642 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  32.86 
 
 
629 aa  319  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  31.75 
 
 
637 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000711928  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  32.19 
 
 
634 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  31.89 
 
 
630 aa  318  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1719  heat shock protein 90  33.81 
 
 
656 aa  317  4e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  32.05 
 
 
634 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  32.85 
 
 
644 aa  317  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  31.65 
 
 
629 aa  317  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  31.65 
 
 
629 aa  317  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  31.99 
 
 
637 aa  317  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  32.71 
 
 
629 aa  317  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  31.61 
 
 
638 aa  317  7e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  31.61 
 
 
637 aa  316  9e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000423215  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19170  heat shock protein 90  32.38 
 
 
635 aa  316  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000174366  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  31.5 
 
 
637 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  31.18 
 
 
637 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0580  heat shock protein 90  32.18 
 
 
653 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.360532 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1998  heat shock protein 90  33.66 
 
 
666 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.154063  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  31.32 
 
 
637 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  32.51 
 
 
629 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  33.14 
 
 
632 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  32.05 
 
 
634 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  32.37 
 
 
637 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3161  heat shock protein 90  33.48 
 
 
625 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0144125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  34.48 
 
 
623 aa  314  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  33.57 
 
 
632 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  33.14 
 
 
634 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  32.62 
 
 
634 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2849  heat shock protein 90  32.28 
 
 
638 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000520054  decreased coverage  0.00000000518986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  31.27 
 
 
637 aa  313  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  31.27 
 
 
637 aa  313  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  31.91 
 
 
634 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  33.14 
 
 
632 aa  313  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3036  heat shock protein 90  32.42 
 
 
629 aa  313  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1798  heat shock protein 90  31.27 
 
 
637 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>