13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5231 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5231  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  100 
 
 		 472 aa  923    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00626423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4750  hypothetical protein  27.39 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5010  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  31.43 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5415  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  31.43 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0868  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.19 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0164  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.3 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4258  hypothetical protein  32.89 
 
 		 633 aa  50.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5463  hypothetical protein  26.19 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.931868  normal  0.0111345 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0530  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.06 
 
 		 1444 aa  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0855  hypothetical protein  25.9 
 
 		 992 aa  46.2  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0860  VirB6 family type IV secretion system protein  25.36 
 
 		 1169 aa  44.3  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.921754  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0498  VirB6 family type IV secretion system protein  21.32 
 
 		 1468 aa  44.3  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0011  hypothetical protein  22.07 
 
 		 382 aa  43.1  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>