37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0008 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0032  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0023  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290353  normal  0.259608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 97 bp  60  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000328562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0062  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0039  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 91 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000237052  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0047  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0212707  normal  0.0426305 
 
 
-
 
NC_002950  PGt17  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0060178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0052  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0039  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0742703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0048  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0101109  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0049  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0041  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.589584  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0024  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0044  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0213479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0035  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.802654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0047  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327618  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0035  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.626616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0019  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.698383 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0005  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0046  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0007  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.715121  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.183333  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1359  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.89612  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1302  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0012  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0470905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>