40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11380 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_11380  predicted aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
321 aa  634    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0783  aminoglycoside phosphotransferase  38.8 
 
 
306 aa  176  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.277231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2477  aminoglycoside phosphotransferase  33.88 
 
 
426 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000140832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2900  aminoglycoside phosphotransferase  35.82 
 
 
386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123406  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2755  aminoglycoside phosphotransferase  32.14 
 
 
401 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133804  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1175  aminoglycoside phosphotransferase  36.07 
 
 
315 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.179937 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2472  aminoglycoside phosphotransferase  35.45 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0185974  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0713  aminoglycoside phosphotransferase  33.92 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15080  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.27 
 
 
345 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27590  predicted aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 
505 aa  122  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19180  predicted aminoglycoside phosphotransferase  30.38 
 
 
306 aa  89  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209047  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0109  putative aminoglycoside phosphotransferase  26.1 
 
 
551 aa  80.5  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0444  hypothetical protein  26.74 
 
 
598 aa  73.9  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1658  aminoglycoside phosphotransferase  29.19 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336937  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3722  putative macrolide 2-phosphotransferase  30.56 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.097524  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2821  aminoglycoside phosphotransferase  34.21 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1446  macrolide 2-phosphotransferase  28.7 
 
 
298 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1659  putative macrolide 2-phosphotransferase  28.7 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.491646 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1445  macrolide 2-phosphotransferase  28.7 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
298 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1473  macrolide 2-phosphotransferase  27.78 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1589  macrolide 2-phosphotransferase  27.78 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.194584  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22410  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.78 
 
 
298 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0662626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2343  aminoglycoside phosphotransferase  32.16 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.421232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  29.57 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1900  kanamycin kinase (aminoglycoside phosphotransferase, gentamicin resistance protein)  24.04 
 
 
293 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4280  hypothetical protein  35 
 
 
243 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  30.23 
 
 
311 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  31.69 
 
 
447 aa  46.2  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  24.66 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1911  aminoglycoside phophotransferase family protein  22.4 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0214215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2179  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase, putative  23.5 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  31.54 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1066  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1881  aminoglycoside phosphotransferase  28.46 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1901  aminoglycoside phosphotransferase  27.64 
 
 
327 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.05669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1947  aminoglycoside phosphotransferase  27.64 
 
 
327 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  29.23 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  28.86 
 
 
331 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  45 
 
 
270 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>