19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5353 on replicon NC_010182
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010182  BcerKBAB4_5353  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
237 aa  488  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0034  hypothetical protein  48.44 
 
 
97 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  31.82 
 
 
603 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.72 
 
 
530 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1366  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.93 
 
 
553 aa  48.5  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  35.29 
 
 
530 aa  48.5  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  31.87 
 
 
578 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.16 
 
 
453 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  28.41 
 
 
574 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1027  hypothetical protein  32.11 
 
 
590 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  30.23 
 
 
578 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  28.41 
 
 
574 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.61 
 
 
392 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.4 
 
 
595 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  29.55 
 
 
584 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.53 
 
 
595 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.46 
 
 
466 aa  42.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 
462 aa  42.4  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 
463 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>