35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7335 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7335  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2163  ThiJ/PfpI  38.79 
 
 
251 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.843992  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.05 
 
 
229 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  30.77 
 
 
227 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2435  ThiJ/PfpI  23.98 
 
 
279 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0616899  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  26.99 
 
 
250 aa  49.3  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1157  ThiJ/PfpI domain protein  26.94 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.32 
 
 
258 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.72 
 
 
224 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0332  intracellular protease, PfpI family  29.71 
 
 
199 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  26.85 
 
 
234 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3997  hypothetical protein  31.82 
 
 
228 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 
232 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22600  putative intracellular protease/amidase  31.98 
 
 
232 aa  46.2  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  32.47 
 
 
228 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0996  PfpI family intracellular peptidase  27.33 
 
 
192 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  hitchhiker  0.000000851254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4585  ThiJ/PfpI domain protein  25.55 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.034255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  32.99 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4458  PfpI family intracellular peptidase  27.33 
 
 
192 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.00124261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  30.3 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.13 
 
 
230 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  34.4 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.75 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0932  PfpI family intracellular peptidase  27.33 
 
 
192 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  30.22 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0893  intracellular protease, PfpI family  27.33 
 
 
195 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  29.67 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  36.36 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  29.41 
 
 
227 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.3 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  30.3 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  29.35 
 
 
221 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0902  peptidase C56, PfpI  29.55 
 
 
191 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  31.4 
 
 
169 aa  42.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>