12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0389 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0389  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  390  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0372  hypothetical protein  83.08 
 
 		 131 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550443  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  80 
 
 		 1520 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  80 
 
 		 1551 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  80 
 
 		 1527 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  80 
 
 		 1550 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  80 
 
 		 583 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  80 
 
 		 598 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3618  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  77.14 
 
 		 1547 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0439  YD repeat-containing protein  80 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703325  normal  0.248849 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  60.61 
 
 		 1560 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>