29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0109 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0361    99.86 
 
 		 848 bp  1352    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00175282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0109    100 
 
 		 690 bp  1368    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  99.57 
 
 		 849 bp  1344    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  99.57 
 
 		 849 bp  1344    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2496  thioredoxin  100 
 
 		 690 bp  1368    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 906 bp  1368    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  93.62 
 
 		 849 bp  1019    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  99.57 
 
 		 2757 bp  1344    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  85.07 
 
 		 849 bp  551  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  83.33 
 
 		 849 bp  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  83.33 
 
 		 849 bp  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  83.19 
 
 		 849 bp  448  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  83.04 
 
 		 849 bp  440  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  82.9 
 
 		 849 bp  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  82.61 
 
 		 849 bp  416  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  88.8 
 
 		 849 bp  137  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  85.62 
 
 		 849 bp  135  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  87.2 
 
 		 849 bp  121  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  85.42 
 
 		 843 bp  79.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  85.26 
 
 		 846 bp  77.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  93.18 
 
 		 846 bp  63.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  81.9 
 
 		 933 bp  63.9  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  81.42 
 
 		 843 bp  58  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  93.75 
 
 		 630 bp  48.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  93.75 
 
 		 630 bp  48.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  100 
 
 		 1200 bp  48.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3575  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  96.43 
 
 		 2214 bp  48.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  93.75 
 
 		 630 bp  48.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  91.67 
 
 		 843 bp  48.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>