52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0947 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0947    100 
 
 
546 bp  1082    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1411    100 
 
 
510 bp  1005    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0316684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1742  hypothetical protein  100 
 
 
186 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1628  hypothetical protein  100 
 
 
186 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0229172  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0604  GST-like protein  100 
 
 
237 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.899714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0506  hypothetical protein  100 
 
 
144 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0775  hypothetical protein  100 
 
 
1494 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.721903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  100 
 
 
1134 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0549    100 
 
 
237 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0938    100 
 
 
537 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0722526  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1266  glutathione S-transferase  100 
 
 
237 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00947497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1561  putative histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
537 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000326314  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0069  peptidase  100 
 
 
570 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.342109  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  100 
 
 
1134 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  100 
 
 
1281 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3027    100 
 
 
237 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.931462  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2594    100 
 
 
807 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1120    100 
 
 
993 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000000733105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0267    100 
 
 
609 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1836  hypothetical protein  100 
 
 
144 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00450659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2091  hypothetical protein  100 
 
 
1245 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0222  putative histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
537 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000092452  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  85.51 
 
 
522 bp  58  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  85.51 
 
 
522 bp  58  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  85.51 
 
 
522 bp  58  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  92.11 
 
 
534 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  92.11 
 
 
429 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  92.11 
 
 
534 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  92.11 
 
 
534 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2726  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
204 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  88.89 
 
 
519 bp  50.1  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  93.94 
 
 
528 bp  50.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  96.3 
 
 
519 bp  46.1  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  96.3 
 
 
519 bp  46.1  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  89.74 
 
 
528 bp  46.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>