32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1411 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



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Replicon accession

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Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0947    100 
 
 
546 bp  1005    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1411    100 
 
 
510 bp  1011    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0316684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  85.51 
 
 
522 bp  58  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  85.51 
 
 
522 bp  58  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  85.51 
 
 
522 bp  58  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  86.89 
 
 
525 bp  58  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  92.11 
 
 
429 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  92.11 
 
 
534 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  92.11 
 
 
534 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2726  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
204 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  86.21 
 
 
528 bp  52  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  92.11 
 
 
534 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  88.89 
 
 
519 bp  50.1  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  93.94 
 
 
528 bp  50.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  96.3 
 
 
519 bp  46.1  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  96.3 
 
 
519 bp  46.1  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  89.74 
 
 
528 bp  46.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
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