39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA3027 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0604  GST-like protein  100 
 
 
237 bp  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.899714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3027    100 
 
 
237 bp  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.931462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0549    100 
 
 
237 bp  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1266  glutathione S-transferase  100 
 
 
237 bp  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00947497  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1491  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 
630 bp  373  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1595  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
630 bp  373  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1461  glutathione S-transferase  98.94 
 
 
630 bp  357  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2794  glutathione S-transferase domain-containing protein  94.15 
 
 
630 bp  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1251  glutathione S-transferase domain-containing protein  85.11 
 
 
630 bp  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.119917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1279  glutathione S-transferase-like protein  85.96 
 
 
630 bp  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111795  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0798  glutathione S-transferase-like  85.96 
 
 
630 bp  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.762924  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1169  glutathione S-transferase domain-containing protein  84.57 
 
 
630 bp  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00510554  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1157  glutathione S-transferase-like protein  84.04 
 
 
630 bp  135  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4422  glutathione S-transferase-like protein  83.51 
 
 
630 bp  127  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.178474  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1628  hypothetical protein  100 
 
 
186 bp  77.8  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0229172  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1742  hypothetical protein  100 
 
 
186 bp  77.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  100 
 
 
1134 bp  77.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  100 
 
 
1134 bp  77.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1836  hypothetical protein  100 
 
 
144 bp  77.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00450659  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0506  hypothetical protein  100 
 
 
144 bp  77.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  100 
 
 
1281 bp  77.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2594    100 
 
 
807 bp  75.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0267    100 
 
 
609 bp  75.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0069  peptidase  100 
 
 
570 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.342109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0938    100 
 
 
537 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0722526  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0775  hypothetical protein  100 
 
 
1494 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.721903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0222  putative histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
537 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000092452  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2091  hypothetical protein  100 
 
 
1245 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1561  putative histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
537 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000326314  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1120    100 
 
 
993 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000000733105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0947    100 
 
 
546 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0405  hypothetical protein  83.7 
 
 
654 bp  63.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.631465  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0129  hypothetical protein  78.77 
 
 
609 bp  54  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0030  Glutathione S-transferase domain  83.13 
 
 
615 bp  54  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0025  Glutathione S-transferase domain protein  83.13 
 
 
615 bp  54  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  100 
 
 
996 bp  50.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  100 
 
 
996 bp  50.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  100 
 
 
1434 bp  50.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7706  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
852 bp  46.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.364073  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>