277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0129 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0129  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0025  Glutathione S-transferase domain protein  79.21 
 
 		 204 aa  323  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0030  Glutathione S-transferase domain  77.72 
 
 		 204 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2587  hypothetical protein  64.5 
 
 		 202 aa  255  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2231  Glutathione S-transferase domain protein  67.5 
 
 		 202 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3329  glutathione S-transferase-like protein  61.19 
 
 		 201 aa  245  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2363  hypothetical protein  60.7 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0713613  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3555  glutathione S-transferase-like  61.39 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0580476  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14290  hypothetical protein  61.39 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.128982  normal  0.822767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1267  hypothetical protein  61.39 
 
 		 203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1491  glutathione S-transferase family protein  57.42 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1595  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.42 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2794  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.46 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1498  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.65 
 
 		 233 aa  224  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1461  glutathione S-transferase  56.94 
 
 		 209 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1169  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.37 
 
 		 209 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00510554  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4422  glutathione S-transferase-like protein  57.69 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.178474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1157  glutathione S-transferase-like protein  57.89 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0798  glutathione S-transferase-like  56.25 
 
 		 209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.762924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1279  glutathione S-transferase-like protein  56.25 
 
 		 209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111795  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1251  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.25 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0405  hypothetical protein  59.9 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.631465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0987  glutathione S-transferase-like protein  56.37 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0668  Glutathione S-transferase domain  53.92 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0989  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.46 
 
 		 202 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4031  putative glutathione S-transferase  54.46 
 
 		 204 aa  206  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0372  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.31 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7065  putative glutathione transferase  36.95 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0552  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.39 
 
 		 129 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0759  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.39 
 
 		 129 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1269  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.39 
 
 		 129 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0601  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.39 
 
 		 129 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178944  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1395  glutathione S-transferase like protein  42.55 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00727348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1266  glutathione S-transferase  68.92 
 
 		 78 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00947497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0604  GST-like protein  68.92 
 
 		 78 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.899714  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2272  Glutathione S-transferase-like protein  34.34 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.31 
 
 		 227 aa  98.6  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2782  glutathione S-transferase-like protein  40.87 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.724853  normal  0.967961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  34.16 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  31 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  36.22 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  32.14 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0702  glutathione S-transferase family protein  32.24 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0693  glutathione S-transferase family protein  32.24 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  31.4 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3449  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.63 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.86 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2584  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.92 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2167  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.29 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.366461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  31.03 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  29.41 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.36 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  38.12 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  28.5 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.64 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2181  glutathione S-transferase domain-containing protein  36 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.86 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  30.27 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  37.5 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  34.72 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  28.86 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.86 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.86 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  29.79 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  27.94 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.59 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  33.11 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1089  Glutathione S-transferase domain  27.27 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600559  hitchhiker  0.000151531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.08 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.72 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  27.09 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6331  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.41 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.39 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  26.96 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  30.89 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  26.96 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  32.45 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  29.83 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06120  hypothetical protein  31.61 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352199  decreased coverage  0.0055796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1562  glutathione S-transferase related protein  24.87 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.572147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  29.84 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  31.09 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  30.77 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.89 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  30.77 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  30.77 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  30.77 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2804  glutathione S-transferase-like protein  32.87 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.515361 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  30.77 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  30.77 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  30.77 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  36.79 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  30.77 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1204  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.56 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  27.72 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  28.57 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  26.11 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>