299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0041 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_t0041  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209251  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1352  tRNA-Ala  97.92 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00031485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0005  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0003  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00134196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0005  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000781338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0005  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000213903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0010  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0070  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.756512  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0012  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0009  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000731062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0056  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0012  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00270892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0041  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0709552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0034  tRNA-Pro  92.45 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.155615  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0020  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0016  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00136922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0006  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0860739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0011  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.193139  normal  0.133058 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0017  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000513914  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Val-1  tRNA-Val  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000143563  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Val-3  tRNA-Val  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0076  tRNA-Val  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0009  tRNA-Val  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000748453  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0004  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000194526  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0004  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000388071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0009  tRNA-Val  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000461705  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0010  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000320815  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0010  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00600624  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0076  tRNA-Val  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0062  tRNA-Val  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0062  tRNA-Val  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0051  tRNA-Pro  92.16 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00100  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1915  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000764546  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0277  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.5301700000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0006  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000243293  hitchhiker  0.00235308 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1330  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00172601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0065  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000014658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0059  tRNA-Pro  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493454  normal  0.0177961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0021  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000715595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0065  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0019  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00103294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00265908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000191328  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0074  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018375  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0009  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000057135  normal  0.0179085 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_R0087  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173535  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0057  tRNA-Pro  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.125773  normal  0.0397591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0083  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000138325  normal  0.683431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0019  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000244639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0003  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1475  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000234459  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1910  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000831958  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1896  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000338005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0003  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000305721  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0086  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000211919  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0017  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000773583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0027  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000717749  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0073  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000273408  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0003  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137148  normal  0.888294 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1989  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000370393  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2045  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1098  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000248852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2896  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000192555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3093  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502528  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0700  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0927  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000140839  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_R0088  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000267621  normal  0.680096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0009  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590045  normal  0.413985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0059  tRNA-Pro  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.867475 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0081  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000458352  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0905  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00645915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0496  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554193  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3831  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394799  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0038  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00088301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0053  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00546912  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0064  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130202  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0085  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0452  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000943072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3542  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00175783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0009  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000573658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0019  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000594786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0065  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0082  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000696423  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0088  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3107  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538271  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1169  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000639478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3541  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000166638  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0005  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000294423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0016  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216953  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0022  tRNA-Pro  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0036  tRNA-Pro  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0009  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000350208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0018  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000940712  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0063  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000409772  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0079  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000825474  normal  0.0444964 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0084  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0103479  hitchhiker  0.00836377 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_R0081  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000215983  normal  0.0761236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>