77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00100 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_00100  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0002  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00110  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0002  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0002  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0002  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0114532  normal  0.0453152 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00090  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0002  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0002  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000554808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0002  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.478829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0002  tRNA-Ala  92.06 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1352  tRNA-Ala  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00031485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0058  tRNA-Ala  90.16 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0350948  hitchhiker  0.00476067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0029  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0010  tRNA-Ala  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0003  tRNA-Ala  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00134196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0005  tRNA-Ala  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000781338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0005  tRNA-Ala  91.49 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0005  tRNA-Ala  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000213903  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0041  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209251  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0015  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000110801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0049  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00105958  hitchhiker  0.000875041 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0026  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0002  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0031  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0202697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0040  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000987892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11500  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.931498  hitchhiker  0.0025263 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0050  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0531103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0056  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0039  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000954288 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0018  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012168  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0041  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00164455  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0042  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0324793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0039  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000377805  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0044  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14002  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0043  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0050  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00215399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0124  tRNA-Pro  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000273434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0123  tRNA-Pro  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000571932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0046  tRNA-Pro  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000279997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0087  tRNA-Pro  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0022  tRNA-Pro  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00039101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0021  tRNA-Pro  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000217303  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0040  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0475845  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0431  tRNA-Ala  90 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.147993  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0037  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0035  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0637572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0034  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.155615  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0059  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.867475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0065  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000795587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0010  tRNA-Ala  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.451721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0036  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0022  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0051  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0062  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0016  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0318  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0057  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.125773  normal  0.0397591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0059  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493454  normal  0.0177961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0001  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0070  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0007  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0014  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0028  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.139647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0002  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0017  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0028  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408156  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0055  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.882837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0037  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0019  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0002  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0002  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0016  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>