22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0208 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0208  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0442  hypothetical protein  76.51 
 
 		 315 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0160  hypothetical protein  75.62 
 
 		 314 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0049  hypothetical protein  85.44 
 
 		 307 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0070  hypothetical protein  75.8 
 
 		 311 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0034  hypothetical protein  77.62 
 
 		 294 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0062  hypothetical protein  76.03 
 
 		 334 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.854831  normal  0.19763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2687  hypothetical protein  52.68 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0088  hypothetical protein  47.52 
 
 		 264 aa  206  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3559  hypothetical protein  41.09 
 
 		 353 aa  180  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0238  hypothetical protein  25.14 
 
 		 195 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3538  hypothetical protein  27.75 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0906  hypothetical protein  26.13 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3877  hypothetical protein  26.13 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.937097  normal  0.0365098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0962  hypothetical protein  26.13 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0205  hypothetical protein  22.16 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0197  hypothetical protein  22.28 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3409  putative lipoprotein  22.28 
 
 		 274 aa  42.7  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.280646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0187  hypothetical protein  22.28 
 
 		 274 aa  42.7  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.656358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3466  hypothetical protein  22.28 
 
 		 274 aa  42.7  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310115  normal  0.308397 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00192  predicted lipoprotein  21.64 
 
 		 274 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00191  hypothetical protein  21.64 
 
 		 274 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.398851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>