16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0962 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3877  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  589  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.937097  normal  0.0365098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0962  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0906  hypothetical protein  99.65 
 
 		 285 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3538  hypothetical protein  47.21 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0205  hypothetical protein  43.03 
 
 		 274 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00192  predicted lipoprotein  43.1 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00191  hypothetical protein  43.1 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.398851  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3409  putative lipoprotein  43.1 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.280646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0197  hypothetical protein  43.1 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3466  hypothetical protein  43.1 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310115  normal  0.308397 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0187  hypothetical protein  43.1 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.656358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0204  hypothetical protein  43.44 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0504389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6529  hypothetical protein  28.88 
 
 		 264 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0088  hypothetical protein  25.38 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0381  hypothetical protein  23.49 
 
 		 196 aa  45.8  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000232223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0208  hypothetical protein  26.13 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>