22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0205 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0205  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  570  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0197  hypothetical protein  95.26 
 
 		 274 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3409  putative lipoprotein  94.89 
 
 		 274 aa  523  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.280646  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00191  hypothetical protein  94.89 
 
 		 274 aa  520  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.398851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0204  hypothetical protein  95.62 
 
 		 274 aa  522  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0504389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0187  hypothetical protein  95.26 
 
 		 274 aa  523  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.656358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3466  hypothetical protein  94.89 
 
 		 274 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310115  normal  0.308397 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00192  predicted lipoprotein  94.89 
 
 		 274 aa  520  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3877  hypothetical protein  41.76 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.937097  normal  0.0365098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0962  hypothetical protein  41.76 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0906  hypothetical protein  41.76 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3538  hypothetical protein  37.12 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1919  hypothetical protein  27.45 
 
 		 154 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.795239 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6529  hypothetical protein  29.41 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2003  NLP/P60 protein  36.92 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000114468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  36.47 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  36.47 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0208  hypothetical protein  22.16 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 150 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  37.31 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0088  hypothetical protein  21.39 
 
 		 264 aa  42.7  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 150 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>