17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0197 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3409  putative lipoprotein  99.64 
 
 		 274 aa  564  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.280646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0197  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  566  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3466  hypothetical protein  99.64 
 
 		 274 aa  564  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310115  normal  0.308397 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0187  hypothetical protein  99.27 
 
 		 274 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.656358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00191  hypothetical protein  97.81 
 
 		 274 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.398851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00192  predicted lipoprotein  97.81 
 
 		 274 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0204  hypothetical protein  96.35 
 
 		 274 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0504389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0205  hypothetical protein  95.26 
 
 		 274 aa  527  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3877  hypothetical protein  43.09 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.937097  normal  0.0365098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0962  hypothetical protein  43.09 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0906  hypothetical protein  43.09 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3538  hypothetical protein  38.86 
 
 		 263 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1919  hypothetical protein  28.1 
 
 		 154 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.795239 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6529  hypothetical protein  27.81 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2003  NLP/P60 protein  30.1 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000114468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0208  hypothetical protein  22.28 
 
 		 326 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  37.04 
 
 		 226 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>