17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3466 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3409  putative lipoprotein  100 
 
 
274 aa  566  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.280646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0187  hypothetical protein  99.64 
 
 
274 aa  565  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.656358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3466  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310115  normal  0.308397 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0197  hypothetical protein  99.64 
 
 
274 aa  564  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00191  hypothetical protein  98.18 
 
 
274 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.398851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00192  predicted lipoprotein  98.18 
 
 
274 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0204  hypothetical protein  96.72 
 
 
274 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0504389  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0205  hypothetical protein  94.89 
 
 
274 aa  525  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0906  hypothetical protein  43.09 
 
 
285 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3877  hypothetical protein  43.09 
 
 
285 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.937097  normal  0.0365098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0962  hypothetical protein  43.09 
 
 
285 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3538  hypothetical protein  38.86 
 
 
263 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1919  hypothetical protein  28.1 
 
 
154 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.795239 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6529  hypothetical protein  27.81 
 
 
264 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2003  NLP/P60 protein  30.1 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000114468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0208  hypothetical protein  21.64 
 
 
326 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  37.04 
 
 
226 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>