40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9618 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9618  Transposase  100 
 
 		 78 aa  160  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346762  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4537  ISSpo6, transposase OrfB  83.33 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  83.33 
 
 		 318 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4477  ISSpo6, transposase OrfB  83.33 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.845836  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  83.33 
 
 		 318 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  83.33 
 
 		 317 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  83.33 
 
 		 317 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  67.74 
 
 		 318 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  54.05 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  54.05 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  54.05 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  54.05 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1156  ISSpo6, transposase OrfB  66.67 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.279659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3437  ISSpo6, transposase OrfB  66.67 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4013  ISSpo6, transposase OrfB  66.67 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1188  ISSpo6, transposase OrfB  66.67 
 
 		 176 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  44.74 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  44.74 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  44.74 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  48.39 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  48.39 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  48.39 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  48.39 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3417  hypothetical protein  42.11 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  51.61 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  48.39 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  48.39 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  48.39 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  48.39 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  48.39 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.11 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.11 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.11 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.11 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.11 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.11 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.11 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  56.67 
 
 		 319 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  56.67 
 
 		 319 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2489  ISRm2011-2 transposase protein  48.39 
 
 		 157 aa  40  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.806618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>