More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1188 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1188  ISSpo6, transposase OrfB  100 
 
 
176 aa  367  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3437  ISSpo6, transposase OrfB  98.86 
 
 
176 aa  362  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4013  ISSpo6, transposase OrfB  98.86 
 
 
176 aa  362  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1156  ISSpo6, transposase OrfB  98.3 
 
 
176 aa  360  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.279659  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  76.14 
 
 
318 aa  292  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  69.94 
 
 
319 aa  260  6.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4477  ISSpo6, transposase OrfB  64.07 
 
 
172 aa  238  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.845836  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4537  ISSpo6, transposase OrfB  64.07 
 
 
172 aa  238  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  63.16 
 
 
317 aa  238  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  63.16 
 
 
318 aa  237  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  63.16 
 
 
317 aa  237  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  63.16 
 
 
318 aa  238  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  61.27 
 
 
319 aa  231  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  61.27 
 
 
176 aa  225  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  61.27 
 
 
176 aa  225  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  61.27 
 
 
176 aa  225  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  61.27 
 
 
176 aa  225  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  59.88 
 
 
314 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  58.33 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  58.33 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  58.33 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  58.33 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  58.33 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  58.33 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  58.33 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  58.33 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  58.33 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  58.08 
 
 
188 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  58.79 
 
 
168 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  56.29 
 
 
188 aa  205  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  56.55 
 
 
315 aa  204  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  56.55 
 
 
315 aa  204  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  56.55 
 
 
315 aa  204  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  56.55 
 
 
315 aa  204  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  55.42 
 
 
315 aa  200  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  58.33 
 
 
315 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  58.33 
 
 
315 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  58.33 
 
 
315 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  58.33 
 
 
315 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  58.33 
 
 
315 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  55.88 
 
 
314 aa  197  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  57.14 
 
 
315 aa  196  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  56.55 
 
 
314 aa  194  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  54.49 
 
 
283 aa  194  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  54.49 
 
 
213 aa  193  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  54.49 
 
 
213 aa  193  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  54.49 
 
 
213 aa  193  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  54.49 
 
 
213 aa  193  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  54.49 
 
 
213 aa  192  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  54.49 
 
 
213 aa  193  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  54.49 
 
 
213 aa  193  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  54.49 
 
 
213 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2693  ISRm2011-2 transposase protein  53.89 
 
 
188 aa  191  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3109  ISRm2011-2 transposase protein  53.89 
 
 
188 aa  191  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  54.22 
 
 
169 aa  191  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  54.76 
 
 
315 aa  191  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  54.76 
 
 
315 aa  191  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  53.89 
 
 
213 aa  189  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  53.89 
 
 
213 aa  189  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1417  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 
188 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154755  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  53.89 
 
 
213 aa  189  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  54.17 
 
 
314 aa  188  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2200  ISRm2011-2 transposase protein  53.29 
 
 
188 aa  187  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.415704  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  54.17 
 
 
191 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  52.73 
 
 
167 aa  178  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  52.73 
 
 
167 aa  178  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  52.73 
 
 
167 aa  178  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  52.73 
 
 
167 aa  178  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  52.73 
 
 
167 aa  178  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  52.73 
 
 
167 aa  178  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  52.73 
 
 
167 aa  178  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  53.29 
 
 
315 aa  177  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  53.29 
 
 
315 aa  177  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8444  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3455  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5622  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0585  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0803  putative ISRm2011-2 transposase protein  50 
 
 
169 aa  176  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3909  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6152  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6103  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6255  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6428  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6832  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7501  putative transposase of insertion sequence  53.94 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.602331  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  50.6 
 
 
213 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  50.6 
 
 
213 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  50.6 
 
 
213 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  50.6 
 
 
213 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  50.6 
 
 
213 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  50.6 
 
 
213 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  50.6 
 
 
213 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  50.6 
 
 
213 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  50.6 
 
 
213 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  50.6 
 
 
213 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  50.6 
 
 
213 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  50.6 
 
 
213 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>