26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8024 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9042  transposase  99.86 
 
 		 717 bp  1413    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8071    100 
 
 		 393 bp  779    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  100 
 
 		 717 bp  1421    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8030    99.75 
 
 		 393 bp  771    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8024    100 
 
 		 717 bp  1421    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  98.33 
 
 		 717 bp  1326    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  84.96 
 
 		 717 bp  551  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8031    98.94 
 
 		 297 bp  539  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  84.38 
 
 		 717 bp  519  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8072  transposase  95.41 
 
 		 285 bp  458  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  81.67 
 
 		 732 bp  329  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7024    83.42 
 
 		 393 bp  250  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7541  transposase  86.31 
 
 		 360 bp  236  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7025    89.87 
 
 		 174 bp  186  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  79.46 
 
 		 543 bp  182  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  78.46 
 
 		 717 bp  139  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  79.29 
 
 		 591 bp  135  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  84.47 
 
 		 699 bp  77.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7247    83.19 
 
 		 642 bp  77.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7237  transposase  93.75 
 
 		 282 bp  71.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319038  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7263  transposase  86.25 
 
 		 315 bp  71.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  89.8 
 
 		 714 bp  58  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1727    85.29 
 
 		 628 bp  56  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  90 
 
 		 714 bp  48.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4715    90 
 
 		 715 bp  48.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.897921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  93.75 
 
 		 702 bp  48.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>