22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8071 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9042  transposase  99.75 
 
 		 717 bp  771    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8071    100 
 
 		 393 bp  779    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  100 
 
 		 717 bp  779    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8030    99.75 
 
 		 393 bp  771    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8024    100 
 
 		 717 bp  779    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  100 
 
 		 717 bp  779    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  83.96 
 
 		 717 bp  266  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7024    83.42 
 
 		 393 bp  250  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  85.38 
 
 		 732 bp  248  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  82.89 
 
 		 717 bp  234  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  81.73 
 
 		 543 bp  105  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  78.81 
 
 		 591 bp  101  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  84.47 
 
 		 699 bp  77.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7263  transposase  86.25 
 
 		 315 bp  71.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7237  transposase  93.75 
 
 		 282 bp  71.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319038  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  79.19 
 
 		 717 bp  65.9  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7247    78.26 
 
 		 642 bp  60  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  89.8 
 
 		 714 bp  58  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  90 
 
 		 714 bp  48.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4715    90 
 
 		 715 bp  48.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.897921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  93.75 
 
 		 702 bp  48.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9132  transposase  79.83 
 
 		 162 bp  46.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>