18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3101 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3101  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  706    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4313  hypothetical protein  47.97 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141383 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4161  hypothetical protein  46.67 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2954  protein of unknown function DUF930  39.66 
 
 		 245 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2696  protein of unknown function DUF930  39.84 
 
 		 245 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2695  protein of unknown function DUF930  28.34 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0117  hypothetical protein  36.73 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.272132  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0101  hypothetical protein  32.28 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0104  hypothetical protein  32.28 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0170  hypothetical protein  32.11 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.034256  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0218  hypothetical protein  31.63 
 
 		 129 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.778956  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1259  hypothetical protein  31.91 
 
 		 129 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0988  protein of unknown function DUF930  28.71 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0861  protein of unknown function DUF930  27.72 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.496506 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.15 
 
 		 2449 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2746  hypothetical protein  44.68 
 
 		 160 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4324  hypothetical protein  30.77 
 
 		 102 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  27.27 
 
 		 1112 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>