17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0117 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0117  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  285  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.272132  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0101  hypothetical protein  74.45 
 
 
134 aa  207  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0104  hypothetical protein  74.45 
 
 
134 aa  207  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0218  hypothetical protein  55.17 
 
 
129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.778956  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0988  protein of unknown function DUF930  50.41 
 
 
129 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0861  protein of unknown function DUF930  53.1 
 
 
129 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.496506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1259  hypothetical protein  46.36 
 
 
129 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4324  hypothetical protein  43.56 
 
 
102 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2746  hypothetical protein  42.72 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0170  hypothetical protein  36.28 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.034256  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2954  protein of unknown function DUF930  38 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2696  protein of unknown function DUF930  36 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4161  hypothetical protein  37.62 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3101  hypothetical protein  36.73 
 
 
365 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4313  hypothetical protein  28.71 
 
 
317 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.141383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2695  protein of unknown function DUF930  41.3 
 
 
356 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2953  protein of unknown function DUF930  36.96 
 
 
355 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>