17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0170 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0170  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  272  9e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.034256  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0218  hypothetical protein  41.6 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.778956  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0988  protein of unknown function DUF930  38.28 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0861  protein of unknown function DUF930  39.47 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.496506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1259  hypothetical protein  34.92 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0117  hypothetical protein  36.28 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.272132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0104  hypothetical protein  34.15 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0101  hypothetical protein  34.15 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2746  hypothetical protein  32.38 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4324  hypothetical protein  34.34 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4161  hypothetical protein  37.14 
 
 		 294 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3101  hypothetical protein  31.43 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2954  protein of unknown function DUF930  34.09 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2696  protein of unknown function DUF930  35.23 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2695  protein of unknown function DUF930  36.54 
 
 		 356 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2953  protein of unknown function DUF930  30.36 
 
 		 355 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>