17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0218 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0218  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  269  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.778956  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0988  protein of unknown function DUF930  57.48 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0861  protein of unknown function DUF930  57.89 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.496506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0101  hypothetical protein  50.39 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0104  hypothetical protein  50.39 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0117  hypothetical protein  55.17 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.272132  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1259  hypothetical protein  48.44 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0170  hypothetical protein  41.6 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.034256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4324  hypothetical protein  42.42 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2746  hypothetical protein  39.39 
 
 		 160 aa  97.1  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2954  protein of unknown function DUF930  31.46 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2696  protein of unknown function DUF930  32.58 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3101  hypothetical protein  31.63 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4313  hypothetical protein  35.29 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141383 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4161  hypothetical protein  32.74 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2695  protein of unknown function DUF930  27.78 
 
 		 356 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2953  protein of unknown function DUF930  32.61 
 
 		 355 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>