15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0988 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0988  protein of unknown function DUF930  100 
 
 
129 aa  269  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0861  protein of unknown function DUF930  93.02 
 
 
129 aa  238  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.496506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0218  hypothetical protein  57.48 
 
 
129 aa  157  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.778956  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1259  hypothetical protein  56.9 
 
 
129 aa  147  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0104  hypothetical protein  51.22 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.62106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0101  hypothetical protein  51.22 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0117  hypothetical protein  50.41 
 
 
136 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.272132  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4324  hypothetical protein  41.41 
 
 
102 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2746  hypothetical protein  35 
 
 
160 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0170  hypothetical protein  38.28 
 
 
132 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.034256  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4313  hypothetical protein  33.03 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.141383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3101  hypothetical protein  28.71 
 
 
365 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2696  protein of unknown function DUF930  28.43 
 
 
245 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2954  protein of unknown function DUF930  26.47 
 
 
245 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4161  hypothetical protein  27.36 
 
 
294 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>